बहादुर निंजा ने निर्दोष लोगों को नुकसान पहुंचाने वाली हर चीज के प्रति अपनी ईमानदारी और अडिग रवैये के कारण कई दुश्मन बना लिए। गेम निन्जाज़ रिटर्न में आप नायक से उसके जीवन के सबसे काले दिनों में से एक पर मिलेंगे। वह घर लौट आया, लेकिन अपने परिवार के साथ एक आनंदमय मुलाकात के बजाय, उसने देखा कि कैसे उसके दुश्मन, ब्लैक निंजा ने उसकी पत्नी का अपहरण कर लिया और उसे एक अज्ञात दिशा में ले गए। नायक तुरंत पीछा करने लगता है, लेकिन दुश्मन तैयार है, वह निन्जा रिटर्न में अपने गुर्गों और वन राक्षसों की मदद से नायक को रोकने की कोशिश करेगा।
